Hoewel de Waterpik Waterflosser C1 veel positieve punten heeft, zijn er ook enkele aandachtspunten die het vermelden waard zijn. Ten eerste kan het vullen van het waterreservoir wat lastig zijn door het compacte en geïntegreerde ontwerp. Het is soms wat onhandig om het reservoir zonder morsen bij te vullen, vooral omdat het niet volledig loskomt van het apparaat. Voor mensen die snelheid en gemak belangrijk vinden, kan dit een kleine ergernis zijn.
Daarnaast ontbreekt er standaard een opberg- of reisetui bij deze waterflosser. Hoewel het apparaat zelf compact is en gemakkelijk mee te nemen, is het fijn geweest als hier een beschermhoes bij zat om het apparaat en de mondstukken netjes en hygiënisch te vervoeren. Dit kan vooral belangrijk zijn voor mensen die vaak onderweg zijn en hun mondverzorgingsproducten in een tas meenemen.
Ook al wordt de batterijduur geroemd, op het moment van laden is het apparaat niet bruikbaar, uiteraard, maar het duurt enige tijd voordat de batterij volledig geladen is. Bovendien geeft het apparaat geen indicatie van de resterende batterijduur, wat soms tot onzekerheid kan leiden over wanneer opladen nodig is.
Tot slot is het waterdebiet instelbaar via standen, maar ontbreekt meer gedetailleerde controle, wat gevorderde gebruikers misschien wat beperkt vinden. De reiniging is krachtig, maar voor mensen die absolute precisie wensen of heel specifieke mondverzorgingsbehoeften hebben, is het misschien niet de allergeavanceerdste optie die Waterpik aanbiedt.